La phylogénie de VIH en Algérie Caractérisation phylogénétique à travers l’ENV

Abstract

La variation génétique et l'évolution rapide du VIH sont l'un des facteurs les plus importants de sa propagation mondiale. En effet, La répartition des différents génotypes varie d’une région continentale à l’autre. Notre étude a pour objectif d’établir une étude phylogénétique du VIH-1 en Algérie, pour déterminer les souches de VIH-1 circulantes, d’analyser leurs origines et de déterminer l’ancêtre commun le plus récent de VIH en Algérie. Cette étude a inclus134 patients résidents en Algérie, infectés par le VIH originaires de différentes régions géographiques de l'Algérie. L’analyse des gènes de l’enveloppe a été réalisée sur le logiciel d'analyse moléculaire « BEAST2 ». Un arbre phylogénique construit avec le modèle sélectionné, tel que mis en oeuvre dans « TRACER 1.7.1 », puis édité et affiché à l'aide « d’Icy.Tree ». Notre population d’étude est constituée de 60% femme et 40% d’homme. L’analyse phylogénique des souches identifiées a montré que le sous-type B est prédominant, alors que les sous-types non-B représentent une grande diversité qui provienne principalement de l’Afrique subsaharienne par le biais de l’immigration et par l’activité d'échange entre les différentes populations.